荒海秘境中的石碑解密需要按照特定顺序激活雷元素方碑。首先找到位于大树旁的三根雷元素柱子，绕着柱子走就能发现它们。激活后中间圆柱封印的门会打开，跳下去就能到达地底。进入后需要解壹个图形谜题，按照前1、左3、左上2、右3、右上2的顺序修改雷柱即可。完成后水位会下降，露出更多可寻觅区域。

来到荒海地下标记位置后，会看到五个并排的雷方碑。这里的决定因素是让全部石碑的花纹面朝给同一路线。用雷元素人物先击打两次靠外面左边的石碑，再击打两次靠里面右边的石碑。中间的雷石碑不能攻击，但会随其他石碑转动而自动调整路线。当全部方碑亮起时，机关就会解开，同时水位会降到最低。

水位下降后继续寻觅，会遇见需要踩踏的石板机关。第一处石板需要从亮起的位置开始，按照一笔画路线逐个踩亮全部石板。成功后会解开中间机关，进入下一区域。第二处石板同样采用一笔画方法，但路线更复杂，提议先规划好途径再行动。踩亮全部石板后隐藏副本千门虚舟就会出现。

如果中途踩错石板导致机关重置，只需从头从凸起的起始石板激活即可。部分区域需要配合雷种子穿过结界或击败遗迹守卫才能继续前进。解密经过中注意观察环境细节，例如地狐雕像也许隐藏着决定因素机关，运用留念镜观察后会显现雷樱枝条或启动装置。完成全部石碑和机关解密后，秘境核心区域会放开，可获取珍贵宝箱奖励。