玩家可以对飞船进行更新，总共有五次更新机会，更新的前置条件是需要招募到足够数量的船员才行。有两种招募船员的方法，第一种是在各个星球的村庄中做任务或者护送物品，这样就能取得村民的信赖。有些村民会主动提议加入大家，此时在对话选项中点击雇佣就能进行招募了。

第二种方法是前往边哨区域的地下酒吧中，从酒保手中购买达龙的信物，信物可以在酒吧商店里兑换唯一企鹅佣兵。每当船员数量达到二的倍数时，都会自动得到一张驾驶执照，这样就能更新飞船。除了驾驶执照以外还需要收集更新模型，玩家开始宝箱或者击杀怪物时都有几率得到更新模型，另外做完支线任务以后会得到奖励包，有较低的概率能刷出更新模型。当收集了足够的更新模型之后，就到船港去找皮特进行飞船更新。

招募到的全部船员都会固定待在船舱中，和他们对话之后可以带着船员一起外出冒险。外出的船员会自动攻击周围的敌人，玩家也可以主动下达指令让他们待命。每个船员都有相应的职业和技能，可以给飞船或者玩家带来增益。

药剂师可以制作不同种类的药剂，例如加速移动或者进步跳跃高度等等。医师可以恢复玩家的血量，技工可以提高飞船的燃料携带上限。玩家可以在舰载PC中查看全部船员的职业情形，也可以在这里解雇船员。